Eine Festplatte an irgendwelche internen (ggf. ungesicherten) USB-Anschlüsse anschließen würde ich nicht wagen.
Weswegen?
Deswegen:
1. Schau mal auf die Festplatte. Die meisten benötigen deutlich mehr als 500mA. Je nach dem wo du deine 5V abgreifst, können die Leitungen überlastet werden und irgendwelche Bauteile durch den hohen Strom zerstören.
Nicht ohne Hintergedanken bekommt man bei "USB-Powered"-Festplattenrahmen ein Kabel dazu, welches man in 2 USB-Slots stecken soll (Wobei 1000mA bei älteren Festplatten auch zu wenig sein kann).
2. Die Einschaltströme von Motoren (auch dem Motor in der Festplatte) liegen deutlich (2- 7-Fach) über dem Betriebsstrom. Wenn also der Betriebsstrom noch im Rahmen wäre, kannst du dir auch mit dem Einschaltstrom dein Mainboard zerhauen.
Also: Entweder genau informieren, wo du solche Ströme abgreifst, oder es lassen